Jeg vet at jeg kan bruke bcftools isec til å sammenligne to VCF-filer som inneholder enkeltnukleotidvarianter (SNVer); det vil generere fire mulige utdatafiler: en med alle de unike kalt SNV-ene i fil 1, en med alle de unike kalt SNV-ene i fil 2, en med alle SNV-ene fra fil 1 som også ble funnet i fil 2, og til slutt en med alle SNV-ene fra fil 2 som også ble funnet i fil 1.

Er det en lignende type verktøy som gjør det mulig å sammenligne strukturelle varianter (SVer) mellom to VCF-filer? Jeg er i ferd med å tilpasse et av Perl-skriptene mine (som for tiden bruker VCF.pm Perl-modulen for å analysere VCF-filer) for å utføre denne beregningen (fordi jeg hittil ikke har funnet noen verktøy designet for SV-er), men jeg trodde jeg ville spørre dette forumet i tilfelle noen andre allerede har oppfunnet dette hjulet.