Kan FASTA-filer inneholde nukleotid- og proteinsekvenser; eller må de bare ha 1 type? For eksempel har en FASTA-fil to sekvenser. Kan den første kode for aminosyrer mens den andre koder for baser?
Takk
Selv om det ikke er noe som hindrer noen i å gjøre det med FASTA-formatet (det er tross alt bare en tekstfil med '>' som definerer overskriftslinjer), jeg vet ikke om noen programvare som støtter en slik filstruktur. I beste fall vil det tolke nukleotidsekvensene som proteinsekvenser (A / C / G / T er alle gyldige proteinkoder på 1 bokstav).
Et bedre spørsmål å stille ville være "Er ultra-kul- bioinformatics-tool X støtte kombinerte nukleotid- og proteinsekvenser i samme FASTA-fil? " I så fall vil svaret mest sannsynlig være "Nei"